Curso de BioEstadistica: Instalando R, rkward y RKTeaching en minino-picaros (2º parte)

Curso de BioEstadística:

Instalando R, rkward y RKTeaching

en minino-picaros (2º parte)

En la primera parte de este post vimos como instalar R y RKward (1º parte), ahora veremos como instalar RKTeaching. En este curso se usa un plugings, llamado RKTeaching, que facilita el manejo del programa y la enseñanza.  Os digo a continuación los pasos a seguir para su instalación.

Agradecer a José Guerero Alves, Aurora Ledezma, y al blog de Emilio L. Cano, por compartir sus conocimientos y experiencias.


0)  Previamente, si no lo teneis instalado en vuestro sistema, hay que instalar en la terminal del sistema varias librerias y compiladores (el g++ y el gfortran):

sudo apt-get install libx11-dev
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev
sudo apt-get install libxml2-dev
sudo apt-get install libcurl4-gnutls-dev
sudo apt-get install g++

sudo apt-get install gfortran

        sudo apt-get install r-cran-rgl 

sudo apt-get build-dep r-cran-rgl

1) Escribir en la consola de R el siguiente comando:

update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE) 

Esto sirve para actualizar actualizar también los paquetes a la última versión de R.(Nota: tardará un ratito en hacerlo, pero es muy importante hacerlo para seguir con los siguientes pasos)

2) Escribre en la consola de R, estas lineas,  (UNA por UNA):

install.packages("R2HTML",dep=TRUE)
install.packages("car",dep=TRUE)
install.packages("e1071",dep=TRUE)
install.packages("Hmisc",dep=TRUE)
install.packages("ez",dep=TRUE)
install.packages("plyr",dep=TRUE)
install.packages("ggplot2",dep=TRUE)
install.packages("prob",dep=TRUE)
install.packages("devtools",dep=TRUE)
library(devtools)
install_github("asalber/rkTeaching_es") 

Nota:

Si tenéis algún mensaje de error, seguramente tendréis que instalar alguna dependencia, alguna librería, o programa. Yo he indicado (en el punto 0) todas las dependencias, librerías y programas que me han sido necesario para instalarlo a mi, pero esto puede depender de vuestra distribución. Echar mano de google si encontrais algún problema ya que yo los he resueltos así (véase Fuentes)

Y reiniciemos el rkward, y se nos muestra información del plugings que acabamos de instalar, le damos a aceptar

Y veremos  el pluging ya instalado:

Saludos

Julio

Fuentes:

Foro de www.miriadax.net/web/curso-practico-bioestadistica-r-3edicion (José Guerrero Alves)
http://emilopezcano.blogspot.com/2012/07/librerias-en-r.html (resolver dependencias con la orden: update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE) )

http://r.789695.n4.nabble.com/problem-with-rgl-package-td887819.html
resolver el error:

checking for X... no
configure: error: X11 not found but required, configure aborted. 

Solución: instalar:

sudo apt-get install libx11-dev
sudo apt-get install libglu1-mesa-dev

http://stackoverflow.com/questions/7765429/unable-to-install-r-package-in-ubuntu-11-04
resolver el error:

checking for xml2-config... no
Cannot find xml2-config
ERROR: configuration failed for package ‘XML’

http://askubuntu.com/questions/359267/cannot-find-curl-config-in-ubuntu-13-04
para resolver el error:

checking for curl-config... no
Cannot find curl-config
ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’